Как рассчитать количество нуклеотидов в экзоне, интроне и в цепи ДНК
Кодирование экзонов и интронов
Задача 96.
Известно, что масса белка составляет 12000 ЕД и что интронная часть кодирующего фрагментя ДНК составляет 40%. 1) Определить количество аминокислот образующих белок.
2) Расчсчитать количество нуклеотидов в экзогенной части ДНК. 3) Рассчитать число нуклеотидов интрона. 4) Рассчитать общее количество нуклеотидов фрагмента ДНК. 5) Рассчитать массу фругмента ДНК. 6) Рассчитать длину интронного участка фругмента ДНК.
Дано:
m(белка) = 12000 ЕД
Интронов=40%
m(ДНК) = ?
L(интрона) = ?
Решение:
L(аминокислоты) = 0,35 нм = 3,5 ангстрем;
L(нуклеотида) = 0,34 нм = 3,4 ангстрем;
Мr (аминокислоты) = 100 а.е.м. (ЕД);
Мr (нуклеотида) = 345 а.е.м. (ЕД).
1. Расчитаем количество аминокислот, образующих белок, получим:
12000/100 = 120.
2. Расчитаем количество нуклеотидов, образующих экзонный часток ДНК, получим:
120 . 3 = 360.
3. Расчитаем количество нуклеотидов, образующих интронный часток ДНК, получим:
(360 . 40)/60 = 240.
4. Рассчитаем общее количество нуклеотидов фрагмента ДНК, получим:
360 + 240 = 600.
5. Рассчитаем массу фругмента ДНК, получим:
600 . 345 = 207000 ЕД.
6. Рассчитаем длину интронного участка фругмента ДНК, получим:
240 . 0,34 = 81,6 нм = 816 ангстрем.
Ответ: 1) 120; 2) 360; 3) 240; 4) 600; 5) 207000 ЕД; 6) 816 ангстрем.
Порядок аминокислот в белковой молекуле
Задача 97.
В приведенной ниже последовательности одного из генов произошло выпадение 9-го нуклеотида, 13-й нуклеотид был заменен на тимин. Цепь ДНК одного из генов: A-A-С-T-G-G-C-A-T-A-A-C-G-C. К какому типу их можно отнести? Если изменения произошли в гене аутосомно-рецессивного заболевания, проявится ли оно?
Решение:
По таблице генетического кода (ДНК) находим порядок аминокислот в белковой молекуле, получим: триплету (ААС) соответствует аминокислота лейцин, триплету (TGG) - треонин, триплету (САТ) - валин, триплету (ААС) - лейцин.
Таким образом, порядок аминокислот в участке молекулы белка будет иметь вид:
лейцин-треонин-валин-лейцин.
Последовательность нуклеотидов в цепочке после измененя будет иметь вид:
A-A-С-T-G-G-C-A-А-A-C-Т-C
Находим порядок аминокислот в белковой молекуле по измененной цепи, получим: триплету (ААС) соответствует аминокислота лейцин, триплету (TGG) - треонин, триплету (САА) - валин, триплету (АСТ) - стоп-кодон (обрыв цепи).
Таким образом, порядок аминокислот в участке молекулы белка после изменения будет иметь вид:
лейцин-треонин-валин.
Так как произошли изменения в гене (участке полипептида), то заболевание проявится.
PS.
Три
Определение цепи ДНК
Задача 98.
Концевая последовательность иРНК включает ААГ-ЦУГ-ГАЦ-УГА. Кодирующая цепь гена содержала интрон ЦАГ перед последним кодоном не считая терминирующего кодона. Определите цепь ДНК.
Решение:
ТТЦ-ГТЦ-ЦТГ-АЦТ-ЦАГ.